Les inventaires généraux de la biodiversité en France et dans le monde - MNHN - Muséum national d'Histoire naturelle Accéder directement au contenu
Rapport Année : 2018

Les inventaires généraux de la biodiversité en France et dans le monde

Résumé

All Taxa Biodiversity Inventory (ATBI) is a comprehensive inventory of all species occurring in a given territory. Its objective is to improve knowledge in taxonomy and chorology and to better understand ecological communities and their interactions within ecosystems. Wherever feasible, it should contribute to a better management of the territory through assessments and monitoring. This report, initiated by the Muséum national d’Histoire naturelle (MNHN) in Paris, presents an overview of the different initiatives worldwide and provides an assessment of the most successful ones. It is based on a consultation of more than sixty documents (i.e. scientific articles, gray literature, websites) and on interviews with dozens of experts involved in ATBI: taxonomists, task managers, technicians, data managers... This document is a first contribution towards a framework for the existing and future ATBIs in France (both mainland and overseas). An exhaustive inventory of flora, fauna and fungi in a network of reference sites is one of the recommendations for a knowledge strategy published by the MNHN and the new French Agency for Biodiversity (Touroult et al., 2017a). The first part describes the origin of the concept developed in the 1990s by North American ecologist Daniel Janzen for a project initially planned in Costa Rica (Guanacaste Conservation Area). The first ATBI was launched in 1998 in the Great Smoky Mountains National Park (USA). With more than 19 000 species described including 940 new species, the results of this ongoing inventory exceeded all expectations and inspired a series of projects worldwide. In North America, a dozen ATBIs were initiated. However, only a few projects actually inventoried a wide range of taxonomic groups. Among them were the ATBIs in Adirondack State Park (2500 species) and in the Boston Harbor Island Recreational Area (1700 species). In Europe, the first and most ambitious ATBI is the Mercantour-Alpi Marittime in the Southern Alps between France and Italy. The project started in the framework of the European Distributed Institute of Taxonomy (EDIT 2006-2011) and continued until 2012 thanks to the collaboration between the two Parks and the MNHN. Field activities and taxonomic research are still ongoing so the actual number of 12 000 species and 30 species new to science is expected to increase. Other European ATBIs were launched by the European Distributed Institute of Taxonomy, such as the ATBI Gemer in Slovakia (3300 species), but most had limited results and none continued after 2012. In France, several ATBIs are currently been conducted: the Mercantour National Park (Southern Alps), the Lauvitel Integral Reserve of the Écrins National Park (Isère), the National Forest Nature Reserve Massane (French Catalonia), the Païolive forest (Ardèche-Gard) and the Bois de Bouis at Vidauban (Var). Other similar initiatives as also noted are the citizen based inventory of Notre-Dame-des-Landes (Pays-de-la-Lore), the marine invertebrate’s inventory in the Guadeloupe National Park and the inventory of the Austral Islands (French Polynesia). ATBIs can also be compared to the new generation of biological expeditions such as "Our Planet Reviewed" which aims to achieve a complete species inventory in the less well-known biodiversity hotspots. Both share similar aims in terms of taxonomic coverage and scientific scope, but ATBIs generally last longer, which allows for a better distribution of sampling effort and possible further valuations in terms of management. In addition, "Our Planet Reviewed" focuses on mega diverse areas whereas ATBIs can be conducted in a wide range of sites including close to urban areas. Other relevant initiatives, at national and regional level, are presented such as the Swedish Taxonomy Initiative and the Hawaii Biological Survey, both of which have the objective of building a comprehensive inventory of biodiversity. The second part of the report provides a review of the key elements of an ATBI. The topics discussed are the location of the inventory, the surface area, setting up the project (objectives, duration, financing), its organization (logistics, coordination, governance), the inventory and sampling strategies, specimens management and identification, data management and dissemination and the uses and promotion of the results (i.e. for research, management and education purposes). Taxonomic impediment is often cited as one the main constraints, since many groups suffer shortage of information and available taxonomists. But other issues are addressed like the need of substantial material and financial resources, the sampling design and the importance of the human factor.
Un inventaire général de la biodiversité ou All Taxa Biodiversity Inventory (ATBI) est un processus d'inventaire coordonné de l'ensemble des espèces présentes dans un espace donné dont l’objectif est de faire progresser la connaissance taxonomique et chorologique et de mieux comprendre les communautés écologiques et leurs interactions au sein des écosystèmes. Il contribue, autant que possible, à une évaluation patrimoniale du territoire et à la mise en place de suivis. Ce rapport, à l’initiative du Muséum national d’Histoire naturelle, a pour objectif de dresser un état des lieux des inventaires généraux de la biodiversité en France et dans le monde et de fournir un retour d’expérience sur les initiatives les plus abouties. Il s’inscrit dans la continuité du diagnostic et des recommandations pour une stratégie d’acquisition de connaissances naturalistes continentales publiés par l’UMS PatriNat (AFB/CNRS/MNHN) à la demande du ministère en charge de l’environnement. Ce rapport participe également d’une volonté de nombreux acteurs d’aboutir à un document de cadrage et d’une réflexion sur un « label » des inventaires généraux de la biodiversité. Le but d’une telle démarche est dans un premier temps de fédérer, d’accompagner et de valoriser les expériences existantes. Mais il s’agit également d’encourager le développement de ces initiatives sur une série de sites de référence en prenant en compte une certaine représentativité notamment biogéographique et écosystémique, en intégrant des sites ruraux et urbanisés en métropole et en Outre-mer. Cette étude se base sur la consultation d’une soixantaine de documents (articles scientifiques, littérature grise, sites internet) et sur des échanges avec plusieurs dizaines d’experts impliqués dans des ATBI en France et dans le monde : taxonomistes, naturalistes, chargés de missions, techniciens, gestionnaires de données… Dans un premier temps, le document retrace la genèse des All Taxa Biodiversity Inventory dans les années 1990 sous l’impulsion de l’écologue nord-américain Daniel Janzen. Initialement prévu au Costa Rica le premier projet d’ATBI voit le jour en 1998 aux Etats-Unis dans le Parc national des Great Smoky Mountains. Les résultats de ce projet, toujours en cours, dépassent les espérances (19 254 espèces recensées dont 940 nouvelles pour la science) et inspirent une série de projets en Amérique du Nord (e.g. ATBI Adirondack, Boston Harbour Island) et à travers le monde. En Europe, l’ATBI transfrontalier du Mercantour-Alpi Marittime est à la fois le premier et le plus ambitieux dans ce domaine avec plus de 12 000 espèces inventoriées et plus d’une trentaine d’espèces nouvelles pour la science. D’autres projets, dans le cadre de l’European Distributed Institute of Taxonomy (EDIT), ont été initiés mais avec des résultats plus mitigés comme l’ATBI Gemer en Slovaquie (3 300 espèces identifiées dont 2 espèces nouvelles pour la science). À l’échelle de la France, il existe une réelle dynamique récente autour des inventaires généralisés de la biodiversité. Parmi les initiatives les plus abouties se trouvent le parc national du Mercantour (Alpes-Maritimes - Alpes-de-Haute-Provence), la Réserve intégrale du Lauvitel du Parc national des Écrins (Isère), la Réserve naturelle nationale de la Forêt de la Massane (Pyrénées-Orientales) et la forêt de Païolive et le plateau des Gras (Ardèche-Gard). D’autres inventaires ambitieux sont également présentés comme les îles Australes (Polynésie française), le site du bois de Bouis à Vidauban (Var), la faune marine du Parc national de la Guadeloupe ou Notre-Dame-des-Landes (Loire-Atlantique). Les inventaires généraux de la biodiversité sont par ailleurs contemporains du renouveau des grandes expéditions naturalistes comme « La Planète revisitée ». Les ambitions en termes de couverture taxonomique et de portée scientifique sont similaires, en revanche les durées des ATBI sont généralement supérieures ce qui permet une meilleure répartition de l’effort de prospection et plus de valorisations possibles en termes de gestion. Par ailleurs, les grandes expéditions naturalistes ciblent des sites à forte naturalité alors que les ATBI sont parfois menés à proximité de territoires fortement anthropisés. Le rapport présente également d’autres initiatives ayant comme objectif la connaissance exhaustive de la biodiversité à l’échelle nationale ou régionale comme le Swedish Taxonomy Initiative ou le Hawaii Biological Survey. Dans une seconde partie, un retour d’expérience est proposé dans le but d’approfondir les éléments les plus structurants d’un projet d’inventaire biologique général. Les thèmes abordés portent sur le choix du territoire, la superficie, le montage du projet (objectifs, durée, financement), son organisation (logistique, coordination, gouvernance), les stratégies d’inventaires et d’échantillonnage, la gestion des spécimens et leur détermination, la gestion et la diffusion des données et la valorisation des résultats (pour la recherche, pour la gestion de la zone d’étude et pour l’éducation). En conclusion, plusieurs points structurants sont mis en évidence dans la perspective d’un réseau français des inventaires généraux de la biodiversité.
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Dates et versions

mnhn-04271668 , version 1 (06-11-2023)

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Identifiants

  • HAL Id : mnhn-04271668 , version 1

Citer

Jean Ichter, Marie-France Leccia, Julien Touroult, Patrick Blandin, Pierre-Henri Aberlenc, et al.. Les inventaires généraux de la biodiversité en France et dans le monde. UMS Patrimoine Naturel (AFB-CNRS-MNHN); Inventaire National du Patrimoine Naturel (MNHN); Parc national du Mercantour. 2018, pp.1-61. ⟨mnhn-04271668⟩
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